appengineでRequest was aborted after waiting too long to attempt to service your request.が出た
1.2.6がリリースされたあたりから急に表題のエラーが頻発しました。原因はたぶんこれだったようです。いまはエラー発生はしていません。
この情報を得るまでに検索していたところ下記の情報が見つかりました。
初期化中のランタイムに対して転送された後続のリクエストは、次のようなエラーになってしまうようです。
Request was aborted after waiting too long to attempt to service your request.